Es difícil lo que pides, en general la organizaciuón de los textos va más por época y padre que por temas, porque no solían ser muy sistemáticos para exponer su doctrina, sino que a menudo un tema que para nosotros puede ser un apartado en sí mismo, como la Eucarstía, aparece en ellos tratado en relación a muchos otros temas, o en conexión con otras exposiciones.
El sitio de El Testgo Fiel cuenta con dos secciones dedicadas a los Padres:
-Los Padres de la Iglesia, donde se reúnen obras en muchos casos difíciles de hallar, organizadas por autor, con introducciones que pueden servir para situar de qué habla cada obra.
-Padres en el Oficio, que son todas las lecturas del ciclo completo del Oficio de Lecturas, con introducción a cada padre o a cada conjunto de lecturas.
Con el tiempo será útil ir agregando a estas ediciones etiquetas temáticas (eucaristía, unidad de la Iglesia, sacerdocio, bautismo, etc.), como las que tienen las preguntas de este libro de prguntas, pero es algo que lleva muchísimo tiempo y no se hace solo, hay que hacerlo a mano, lectura por lectura.
Fuera de ETF, el que tiene muy buenas colecciones de textos de los Padres aunque muchas veces sin mención de la fuente, es Mercabá. Lamentablemente la organización del material en tan completísimo sitio es algo caótica, muy difícil encontrar algo. Mi consejo es que si se quiere buscar allí se aprenda a buscar con Google, pero especificando el sitio (antes de la consulta en google se pone "site:mercaba.org", sin las comillas, luego un espacio y la consulta), Por ejemplo ir a Google y en el casillero de búsqueda poner (no las comillas):
"site:mercaba.org eucaristía en los Padres"
se verán muy buenos resultados.
También el sitio curas.com.ar tiene buen material temáticamente organizado, pero no hay un índice al que recurrir, hay que usar el mismo procedimiento:
"site:curas.com.ar eucaristía en los Padres"